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小鼠呼吸波形行为标注分析系统 · Mouse respiratory waveform annotation & analysis (whole-body plethysmography). Windows 安装包与更新清单分发仓库,不含源代码。

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TrueRespi — 小鼠呼吸波形行为标注分析系统

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这是什么

TrueRespi 是面向**小鼠清醒全身体积描记(WBP)**的本地桌面工具:把 EMKA 等设备导出的原始呼吸流量波形 读进来,人工标注行为片段,再用内置行为模型做预标注,最后把逐呼吸参数、分段统计与图表一次性导出到 Excel。

本仓库只分发 Windows 安装包与更新清单,不包含源代码。 源码、测试与开发文档不在本仓库发布。

TrueRespi 主窗口:波形、行为标注与指标泳道 主窗口(浅色)— 真实 10 分钟 EMKA 记录,标注段由呼吸检测结果派生

下载与安装

版本 文件 适用场景
安装版(推荐) TrueRespi-<版本>-Setup.exe 需要开始菜单/桌面快捷方式、支持应用内自动覆盖升级
免安装版 TrueRespi-<版本>-win64-portable.zip 解压即用,适合无安装权限或便携部署
校验文件 SHA256SUMS.txt 下载后核对完整性

👉 下载最新版本

系统要求

项目 要求
操作系统 Windows 10 / 11,64 位
内存 4 GB 以上;处理数小时录音建议 8 GB 以上
磁盘 约 1 GB 可用空间(模型与运行库随包分发)
显卡 可选。支持 DirectML 的显卡会自动加速模型推理,无显卡时回退 CPU

安装步骤

  1. 下载 TrueRespi-<版本>-Setup.exe 并双击运行。
  2. 安装向导会请求管理员权限;若检测到正在运行的旧版本,会自动关闭后再替换文件。
  3. 完成后从开始菜单或桌面快捷方式启动。

安装包未做商业代码签名,Windows SmartScreen 可能提示"未知发布者"。请确认文件确实来自本仓库 Releases,并用 SHA256SUMS.txt 校验后再运行。

免安装版:解压到任意可写目录(不要在压缩包内直接运行),双击目录中的 TrueRespi.exe。 用户设置保存在 %APPDATA%\TrueRespi,项目与导出文件保存在你选择的目录。


主要能力

标注工作台

  • 波形浏览:多通道叠加、缩放平移、按时间跳转,GPU 加速渲染长录音。
  • 行为标注:拖选区间即标注,支持自定义行为标签与颜色;允许区间重叠(共同标注)。
  • 项目文件:保存为 .truerespi 工程,随时续标;旧版 .deeprespi 工程仍可直接打开。

模型预标注

内置 9 个 Pneuma 行为模型,覆盖五类行为(moving / grooming / sniff / eupnea / sleep),可在同一份数据上横向对比:

模型 架构与定位
condor (推荐默认) 4 模型 softmax 概率平均后接 HMM;准确率最高
falcon 单模型最优,macro-F1 全场最高、泛化最强,与 condor 仅差 0.22pp
heron 机器学习类最优,仅需 103 维特征、不读原始波形,CPU 上最快
osprey Pneuma 主干 V9 分支架构,长上下文表现突出
swift 更轻量的机器学习模型,CPU 友好;macro-F1 略低于 heron
eagle / kite / raven / swan 四个单模型骨干变体(V9 / V95 / InceptWave V70 / S4D-k255),用于骨干架构横向对照

推理走 ONNX,优先 DirectML GPU,失败自动回退 CPU;结果以行为段形式落到标注层,可逐段人工修订。

呼吸指标

  • 逐呼吸输出 23 列(Ti Te P f PIF PEF TV EV MV RT … IF50),对齐 emka IOX 的 22 列口径并附派生量;泳道与窗口聚合使用其中 15 项核心参数。
  • 指标注册表 56 项,分五类(时序 / 幅度 / 变异性 / 事件 / 推论),每项含中文名、定义、公式、 单位与最小数据条件。
  • 不可用即留空:仪器没测到、数据不足或计算失败一律写 NaN,绝不填 0 伪造—— 导出表里"留空"与"测到 0"始终可区分。
分析工作台:指标泳道、分段趋势与统计面板 分析工作台 — 指标泳道与分段趋势联动,左侧为文件概览与通道指标

Excel 导出

导出类型 内容
行为标注 Excel Sheet1 标注明细、各行为分窗统计(1/3/5/10 分钟)、30 分钟分段、趋势图、指标说明
全部数据 Excel 在行为工作簿基础上,追加「呼吸指标_每秒」与「呼吸指标_每分钟」两张表

「说明」工作表按实际产出的工作表逐条陈述,不会出现"文档说有、文件里没有"。


更新

  • 安装版启动后会延迟检查更新,也可随时 帮助 → 检查更新。
  • 发现新版本后可在应用内下载,完成 SHA-256 校验后再运行安装程序;同 AppId 覆盖安装, 保留用户设置。
  • 免安装版请从 Releases 下载新版 zip 覆盖程序目录,项目与导出文件不受影响。
  • 更新清单:update/manifest.json。

文件校验

Get-FileHash .\TrueRespi-<版本>-Setup.exe -Algorithm SHA256
Get-FileHash .\TrueRespi-<版本>-win64-portable.zip -Algorithm SHA256

与 SHA256SUMS.txt 比对。校验不一致请勿运行,重新下载。


数据与隐私

  • 全程本地处理:原始录音、标注、项目文件都不会上传到任何服务器。
  • 应用内更新只访问本仓库的更新清单与发布资产。
  • 反馈问题时请勿附带未授权的动物数据、个人信息或含敏感路径的截图。

反馈

反馈时请提供:软件版本(关于页可见)、Windows 版本、数据格式、复现步骤与日志片段(请先脱敏)。


许可证

TrueRespi 以 MIT License 发布,详见 LICENSE。 第三方组件许可见安装目录中的 THIRD_PARTY_LICENSES.txt。

© 2026 TrueRespi Team · TrueRespi 名称与标识保留所有权利

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